Mikrobiologie, imunologie a obecná infektologie

Sylabus

Imunologie

1)     Přehled přirozené a adaptivní imunity

2)     Autoimunní onemocnění

3)     Imunopatologické reakce hypersenzitivity (Typ I – IV)

4)     Zánět. Imunita na kůži a sliznici

5)     Imunodeficience primární a sekundární

6)     Antiinfekční imunita

7)     Atopické choroby,  Anafylaxe.

8)     Imunoterapie, vakcinace

9)     Transplantační, nádorová imunita. Imunohematologie

10)  Systémové autoimunity - případové studie.

11)  Orgánové autoimunity - případové studie

12)  Indikace a interpretace laboratorního imunologického vyšetření

13)  Potravinová alergie, léková alergie

14)  Alergeny, alergie dýchacích cest

15)  Imunodeficience - případové studie.

16)  Laboratorní diagnostika I

17)  Klinická vyšetření imunologie/alergologie

18)  Laboratorní diagnostika II   Obecná a speciální bakteriologie

19)  Lékařská mikrobiologie. Úvod. Bakteriologie. Stavba buňky. Morfologie.

20)  Mykologie. Taxonomie. Kvasinky, plísně, dimorfní houby. Antimykotika.

21)  Antibiotika - přehled, mechanismy účinku, mechanismy rezistence, příklady klinického použití.

22)  Parazitologie. Obecná parazitologie. Protozoa, helmintózy. Antiparazitika.

23)  Virologie. Obecná virologie - taxonomie virů, průkaz virové infekce. Speciální virologie - DNA a RNA viry. Antivirotika.

24)  BOZP, přístroje, tok vzorků: Studenti jsou seznámeni s bezpečnostními pravidly práce v mikrobiologické laboratoři a organizací výuky. Dezinfekce a sterilizace. Preanalytická fáze. Odběr a uchování materiálu, transport. Fyziologická flóra, primární, oportunní patogeny

25)  Základní principy mikrobiologické diagnostiky: Analytická fáze. Přímý průkaz

1. část (mikroskopie). Barvení (princip), aplikace mikroskopie, popis preparátu, morfologie. Nepřímý průkaz. Sérologické metody - principy (aglutinace, precipitace, komplement-fixace, ELISA).

26)  Základní principy mikrobiologické diagnostiky 2: Přímý průkaz

2. část (kultivace) kultivační půdy, délka kultivace, prostředí. Vyšetření citlivosti k ATB. Metody vyšetření citlivosti - diskový difúzní test, bujónová mikrodiluční metoda, E-test.

27)  Přímý průkaz

3. část (identifikace bakterií) - morfologie, biochemie, MALDI- TOF MS, PCR). Vyšetření citlivosti k ATB. Break-point, interpretace nálezu.  Postanalytická fáze. Interpretace mikrobiologického vyšetření,

28)  Stafylokoky. Diagnostika stafylokoků na základě jejich biochemických vlastností. Stafylokokové toxiny. Přehled klinických forem onemocnění, základy terapie, výskyt rezistence na ATB, epidemiologické souvislosti

29)  Streptokoky. Nejvýznamnější druhy - morfologie, identifikace, faktory virulence a patogenita, laboratorní diagnostika, kultivace - podmínky, růstové vlastnosti, identifikace – bacitracin, optochin, deoxycholát, hemolýza

30)  Enterobakterie. Diagnostika, kultivace, identifikace (biochemie, aglutinace), klinický význam, antibiogram, produkce ESBL

31)  Pseudomonády a další nefermentující tyčinky. Diagnostika klinicky významných nefermentujících tyčinek. Význam u oportunních/nemocničních nákaz. Cystická fibróza.

32)  Bordetely, hemofily, neisserie. Nejvýznamnější zástupci rodů. Kultivace, podmínky, růstové vlastnosti, faktory virulence, identifikace a sérotypizace bakteriálních kmenů, satelitismus.

33)  Mykobakteria, nokardie, korynebakteria. Diagnostika patogenních a nepatogenních druhů, barvení, kultivační půdy, průkaz toxigenity kmenů.    Klinická mikrobiologie

34)  Alimentární infekce. Virové, bakteriální a parazitární nákazy.

35)  Respirační nákazy. Chřipka. TBC

36)  Sexuálně přenosná onemocnění. Kapavka, Chlamydie, Syfilis, HIV, virové hepatitidy.

37)  Vaccine-preventabilní nákazy. Povinné, doporučené očkování v ČR

38)  Vektorové infekce (klíště, komár, veš, ploštice). Domácí a importované nákazy.

39)  Nemocniční nákazy. Původci, symptomatologie, diagnostika a terapie nemocničních infekcí a infekcí krevního řečiště.

40)  Alimentární infekce. Interaktivní kazuistiky.

41)  Infekce respiračního traktu. Interaktivní kazuistiky.

42)  Infekce CNS. Interaktivní kazuistiky.

43)  Infekce močového traktu. Interaktivní kazuistiky.

44)  Sexuálně přenosná onemocnění. Interaktivní kazuistiky.

45)  Infekce kůže a měkkých tkání. Infekce kostí a kloubů. Interaktivní kazuistiky.

46)  Systémové infekce. Interaktivní kazuistiky.    Speciální patologie

47)  Stafylokoková a streptokoková onemocnění, včetně jejich sterilních následků

48)  Infekce respiračního traktu (speciální patologie)

49)  Granulomatózní záněty a mykózy

50)  Infekční onemocnění střeva (speciální patologie)

51)  Záněty CNS (speciální patologie)

52)  Onkogenní viry   Obecná infektologie

53)  Střevní infekce

54)  Infekce močových cest

55)  Infekce pojivové tkáně

56)  Infekce jater

57)  Vysoce nebezpečné nákazy a bioterorismus

58)  Infekce dýchacích cest

59)  Infekce CNS

60)  Zoonózy a nákazy s přírodní ohniskovostí

61)  Diagnostické metody v infektologii

62)  Komplexní léčba infekčních nemocí

63)  Ukázka klinické diferenciální diagnostiky v infekčním lékařství

64)  Respirační infekce a neuroinfekce

65)  Provoz infekčního oddělení, vysoce nebezpečné nákazy

66)  Akutní průjmové infekce, nozokomiální infekce   Farmakologie

67)  Antivirotika

68)  Antimykotika

69)  Antituberkulotika

Anotace

Modul Mikrobiologie, imunologie a obecná infektologie prezentuje etiopatogenezi infekčních onemocnění, poskytuje přehled o původcích infekčních onemocnění, principech laboratorní i klinické diagnostiky infekčních chorob a jejich léčby, prezentuje nemoci a jejich manifestaci dané poruchami imunitních funkcí. Studenti si osvojí znalosti v oboru obecné a speciální mikrobiologie, imunologie a obecné infektologie, v předmětu jsou paralelně vyučovány příslušné části speciální patologie a farmakologie.

Studenti jsou seznámeni s praktickými aspekty oborů, tj. možnostmi diagnostiky infekčních chorob, jejími indikacemi, vyhodnocením a interpretací klinické významnosti nálezu, dále i prevenci infekčních chorob pomocí vakcinace a léčby antiinfektivy. Pozornost je věnována též nemocničním nákazám a problematice antibiotické rezistence. Jsou vyučovány základy imunodeficiencí, autoimunitních nemocí a alergických chorob. Studenti jsou formou interaktivních kasuistik simulujících reálné situace vzděláváni vedeni k integrovanému přístupu v diagnostice a léčbě infekčních chorob a imunopatologických stavů. Výuka předmětu rozvíjí aplikaci znalostí mikrobiologie, imunologie, infektologie a histopatologie do klinické praxe. Na výuce se podílí Ústav mikrobiologie, Ústav imunologie a klinické biochemie, Ústav patologie, Ústav farmakologie a Klinika infekčních nemocí.