Průkaz infekčního původce ve vyšetřovaném biologickém materiálu pomocí molekulárně-genetických analýz

Sylabus

Během kurzu budou studenti po krátkém teoretickém úvodu prakticky seznámeni s metodami:1) extrakce a purifikace nukleových kyselin z výchozího materiálu (sérum, plasma, moč, stěry) pomocí separačních kolonek nebo paramagneticých částic.2) reverzní transkripce pro přípravu copy DNA a následnou amplifikaci DNA metodou PCR (endpoint PCR)

3) real time PCR s přímou vizuální detekcí amplifik. produktu změnou hladiny fluorescence, včetně možnosti následného stanovení genotypu z hodnoty MP po kontinuální tep.denaturaci4) klasické elektroforetické detekce PCR produktu v agarosovém gelu5) přímé sekvenační analýzy genomu pro určení genotypu pomocí sekvenačního analyzátoru

Anotace

Během kurzu budou studenti seznámeni s metodami užívanými při průkazu a typizaci původce metodou PCR.