Syllabus
1 Introduction to optical microscopy and historical overview 2 Microscopic methods in bright field 3 Fluorescence microscopy 4 Spinning disc 5 Confocal laser scanning microscopy 6 Live Cells Imaging in widefield, confocal and light sheet 7 FRAP, FRET, FLIM and FCS 8 Nonlinear microscopy - 2P, SHG, CARS 9 Subdiffraction imaging methods - SIM, AiryScan 10 Nanoscopy 1 - STORM, PALM, GSD 11 Nanoscopy 2 - STED 12 Practical part - WF imaging with Leica TCS SP5 13 Practical part - confocal imaging with Leica TCS SP5
Annotation
Kurz navazuje na část předmětu CCOCA0091 Advanced methods in microscopy (Základy mikroskopických metod a digitální zobrazování) a zaměřuje se na metody optické mikroskopie, které se v současné době používají v medicíně a biologii. Obsahem kurzu jsou metody widefield fluorescence, spektrálně a časově rozlišené konfokální mikroskopie, deep tissue imaging, subdifrakční zobrazování a nanoskopie pro fixované i živé vzorky.
Z pokročilých metod budou probrány ligh-sheet, FRAP, FRET, SHG, THG, FLIM, FCS, 4Pi, GSD, STED, PALM, SIM, CARS a mnoho dalších v závislosti na aktuálním pokroku ve výzkumu a vývoji. Součástí kurzu bude i praxe na konfokalním laserovém skenovacím mikroskopu Leica TCS SP5 ve wide-field i konfokálním režimu