Basic and advanced methods of optical microscopy in medicine and biology

Sylabus

* 1 Introduction to optical microscopy and historical overview

* 2 Microscopic methods in bright field

* 3 Fluorescence microscopy

* 4 Spinning disc

* 5 Confocal laser scanning microscopy

* 6 Live Cells Imaging in widefield, confocal and light sheet

* 7 FRAP, FRET, FLIM and FCS

* 8 Nonlinear microscopy - 2P, SHG, CARS

* 9 Subdiffraction imaging methods - SIM, AiryScan

* 10 Nanoscopy 1 - STORM, PALM, GSD

* 11 Nanoscopy 2 - STED

* 12 Practical part - WF imaging with Leica TCS SP5

* 13 Practical part - confocal imaging with Leica TCS SP5

Anotace

Kurz navazuje na část předmětu CCOCA0091 Advanced methods in microscopy (Základy mikroskopických metod a digitální zobrazování) a zaměřuje se na metody optické mikroskopie, které se v současné době používají v medicíně a biologii. Obsahem kurzu jsou metody widefield fluorescence, spektrálně a časově rozlišené konfokální mikroskopie, deep tissue imaging, subdifrakční zobrazování a nanoskopie pro fixované i živé vzorky.

Z pokročilých metod budou probrány ligh-sheet, FRAP, FRET, SHG, THG, FLIM, FCS, 4Pi, GSD, STED, PALM, SIM,

CARS a mnoho dalších v závislosti na aktuálním pokroku ve výzkumu a vývoji.

Součástí kurzu bude i praxe na konfokalním laserovém skenovacím mikroskopu Leica TCS SP5 ve wide-field i konfokálním režimu