Patologie vyučuje obecné patologické pochody ve tkáních - tzv. obecná patologie a tzv. speciální patologie učí rozpoznávat jednotlivé chorobné děje v orgánových systémech. U čí studenty tzv. regresivní a progresivní změny, nauku o zánětu a z morfologického pohledu obrazy a patologické nálezy nejdůležitějších infekčních chorob, onkologickou problematiku, patologii dětského věku od prenatální patologie (včetně patologie nejčastějších vrozených vývojových vad) po problematiku patologie a chorob dospívajících. Ve speciální patologii probírá všechny orgánové a tkáňové systémy a jejich základní patologické poruchy.
Obor využívá ve výuce morfologické přístupy hodnocení normálních a patologických nálezů prostým okem, po zpracování tkání pomocí histologických technik a barvení a učí rozpoznávat studenty nálezy pod mikroskopem.
Využívá k tomu také výsledků specializovaných laboratoří - imunohistochemických metod, metod hybridizačních a ve vybraném okruhu hematopatologie i výsledků získaných průtokovou cytometrií. Vedle toho se celý obor zaměřuje na rozšiřující se spektrum znalostí na úrovni molekulární podstaty chorob, zejména v oblasti onkologie, kardiologie a neuromuskulárních onemocnění. Učí studenty k přístupu nejen memorovat naučenou problematiku, ale zejména dokázat spojovat nálezy různých laboratorních přístupů v syntetické diagnostické závěry. Obor staví na pilířích anatomie, biologie, fyziologie, biochemie a histologie se orientuje na uplatnění znalostí a dovedností v praktické diagnostice v dalších ročnících studia a klinické praxi.