Klinická praxe trvá 6 týdnů (30 pracovních dnů, 480 hodin), pracovní doba studentů je 8,5 hod. denně (30 min. je oběd) a její začátek lze přizpůsobit potřebám rehabilitačního pracoviště. 4 týdny si student zajišťuje praxi na pracovišti či pracovištích dle vlastního výběru, 2 týdny probíhají v rámci praxe ve FN Motol.
Samostatná práce s pacienty odpovídající již dosaženému bakalářskému vzdělání oboru fyzioterapie