Biobanking for biomarker assessment and their benefits for patients

Syllabus

1. Biomarkery - význam pro personalizovanou medicínu; biomarkery tkáňové, cirkulující a genetické; nádorové biomarkery, jejich úloha v klinickém rozhodování, indikace a interpretace výsledků

2. Laboratorní imunoanalytické metody -využití pro stanovení cirkulujících biomarkerů - radioimunoanalýza, enzymoimunoanalýza, chemiluminiscence, multiplexové metody

3. Metody digitální patologie -využití pro stanovení tkáňových biomarkerů

4. Metody molekulární biologie -využití pro stanovení genetických markerů - real time PCR, digital droplet PCR, izolace nukleových kyselin

5. Využití kombinace technik laboratorních, patologických a zobrazovacích pro klinické rozhodování v onkologii

6. Biobanky - úloha v medicíně a biomedicínském výzkumu, vybavení, základní požadavky na provoz, etická, sociální a právní hlediska

7. Praktická cvičení (LF Plzeň) - seznámení s biobankou tekutých vzorků a s imunoanalytickou laboratoří, příprava vzorků séra/plazmy, izolace a uchovávání DNA/RNA

8. Praktická cvičení (Institut patologie, Univerzita Regensburg) - seznámení s moderními metodami digitální patologie, příprava tkáňových vzorků Závěrečná práce na volitelné téma (rozsah 10-20 stran A4)

Annotation

Volitelný předmět je zaměřen na využití biomarkerů v personalizovaném lékařství (tj. lékařství „šitém na míru“ pacientovi), na metody jejich stanovení a význam uchovávání a sdílení biologických vzorků v biobankách pro studium biomarkerů.

Předmět propojuje několik oborů, jako biochemii, patologii a zobrazovací metody, a klade důraz na praktické využití této

„symbiózy“ pro klinické rozhodování a tedy benefit pacienta, ale i pro biomedicínský výzkum. V rámci předmětu se studenti prakticky seznámí s dvěma typy klinických a zároveň výzkumných pracovišť: Laboratoří pro imunoanalýzu a

Biobankou FN Plzeň a s partnerským pracovištěm Ústavem patologie a biobankou Univerzity Regensburg. Výstupem bude krátká samostatná práce na zvolené téma. Absolvování předmětu bude uznáno Univerzitou Regensburg jako součást jejich curricula.

Předmět bude vyučován v anglickém jazyce, je však určen pouze pro české studenty!.