Mikrobiologie I

Sylabus

Přednášející: prof. MUDr. Pavel Boštík, Ph.D. doc. RNDr. Vladimír Buchta, CSc.

MUDr. Pavla Paterová, Ph.D.

MUDr. Vlasta Štěpánová, Ph.D.

Přednášky

Lékařská mikrobiologie. Úvod. Bakteriologie. Stavba buňky. Morfologie. (prof. Boštík)

Virologie. Obecná virologie - taxonomie virů, průkaz virové infekce. Speciální virologie - DNA a RNA viry. Antivirotika. (dr. Štěpánová)

Mykologie. Taxonomie. Kvasinky, plísně, dimorfní houby. Antimykotika. (doc. Buchta)

Parazitologie. Obecná parazitologie. Protozoa, helmintózy. Antiparazitika. (prof. Boštík)

Antibiotika - přehled, mechanismy účinku, mechanismy rezistence, příklady klinického použití. (dr. Paterová)

Praktika a  semináře

Praktická cvičení

BOZP, přístroje, tok vzorků.  Studenti jsou seznámeni s bezpečnostními pravidly práce v mikrobiologické laboratoři a organizací výuky. Dezinfekce a sterilizace. Preanalytická fáze. Odběr a uchování materiálu, transport.

Základní principy mikrobiologické diagnostiky. Přímý průkaz 1. část (mikroskopie). Barvení (princip), aplikace mikroskopie, popis preparátu, morfologie.

Základní principy mikrobiologické diagnostiky. Přímý průkaz 2. část (kultivace) kultivační půdy, délka kultivace, prostředí. Vyšetření citlivosti k ATB. Metody vyšetření citlivosti - diskový difúzní test, bujónová mikrodiluční metoda - vyšetření minimální inhibiční koncentrace (MIC) - prinicip

Přímý průkaz 2. část (identifikace bakterií - morfologie, biochemice, MALDI- TOF MS). Vyšetření citlivosti k ATB. Break-point, interpretace nálezu. Postanalytická fáze. Interpretace mikrobiologického vyšetření, fyziologická flóra, primární, oportunní patogeny

Základní principy mikrobiologické diagnostiky. Nepřímý průkaz. Vyšetřovací metody ve virologii. sérologické metody - principy (aglutinace, precipitace, komplement-fixace, ELISA). Virologie - přímý průkaz

Základní principy mikrobiologické diagnostiky. Vyšetřovací metody v mykologii a parazitologii.Molekulárně genetické metody. Mikroskopie, kultivace. Princip PCR, výhody a nevýhody molekulárně genetických metod. Jejich indikace v klinické praxi.

Stafylokoky. Diagnostika stafylokoků na základě jejich biochemických vlastností. Stafylokokové toxiny. Přehled klinických forem onemocnění, základy terapie, výskyt rezistence na ATB, epidemiologické souvislosti

Streptokoky. Nejvýznamnější druhy - morfologie, identifikace, faktory virulence a patogenita, laboratorní diagnostika, kultivace - podmínky, růstové vlastnosti, identifikace – bacitracin, optochin, deoxycholát, hemolýza

Enterobakterie. Diagnostika, kultivace, identifikace (biochemie, aglutinace), klinický význam, antibiogram, produkce ESBL

Pseudomonády a další nefermentující tyčinky. Diagnostika klinicky významných nefermentujících tyčinek. Význam u oportunních/nemocničních nákaz. Cystická fibróza.

Bordetely, hemofily, neisserie. Nejvýznamnější zástupci rodů. Kultivace, podmínky, růstové vlastnosti, faktory virulence, identifikace a sérotypizace bakteriálních kmenů, satelitismus. Zápočtový test.

Mykobakteria, nokardie, korynebakteria. Diagnostika patogenních a nepatogenních druhů, barvení, kultivační půdy, průkaz toxigenity kmenů. Zápočet. 1. sk. Po 5. - 7. hod.    Út 5. - 7. hod. Mgr. R. Kukla, Ph.D., Mgr. R. Sleha, Ph.D. 2. sk. Čt 1. -3. hod.     Pá 1. - 3. hod. Mgr. Marcela Vejsová, Ph.D. 3. sk. Po 9. - 11. hod.  Út 1. - 3. hod. MUDr. K. Kuncová, PharmDr. J. Bavlovič, Ph.D.     4. sk. St 1. - 3. hod.    Čt 5. - 7.hod.   MUDr. Kateřina Neradová, Ph.D.    5. sk. Út 1. - 3. hod.    St 1. - 3. hod.  doc. MUDr. Pavel Čermák ,Ph.D. 6. sk. Po 1. - 3. hod.    Út 5. -7. hod.  doc. MUDr. Pavel Čermák, Ph.D.

Anotace

Lékařská mikrobiologie je obor zabývající se etiologií, patogenezí a imunogenezí humánních onemocnění vyvolaných mikroorganismy (bakterie, viry, houby, plísně, parazité). Obor je členěný na speciální části dle typu mikroorganismu vyvolávajícího vlastní onemocnění (bakteriologie, virologie, mykologie, parazitologie) a zabývá se i antiinfekční imunitou (sérologie). Předmětem Mikrobiologie I je úvod do problematiky mikrobiologie, seznámení se základními obecnými charakteristikami jednotlivých lékařsky významných skupin mikroorganismů (bakterie, viry, houby, parazité) a principy laboratorní diagnostiky infekčních chorob.

Výuka předmětu probíhá formou přednášek, které se jsou koncipovány jako obecný přehled jednotlivých podoborů mikrobiologie (bakteriologie, virologie, mykologie a parazitologie), samostatná přednáška je věnována terapii infekčních onemocnění (charakteristika antibiotik, mechanismy účinku a rezistence, priority klinického využití). Na seminářích a praktických cvičeních si studenti osvojí základními principy mikrobiologické diagnostiky: metody přímého průkazu (mikroskopie, kultivace, identifikace, vyšetření citlivosti k antibiotikům, speciální metody průkazu rezistence, molekulárně biologická diagnostika; výhody a nevýhody molekulárně genetických metod) a nepřímého průkazu (sérologická diagnostika) a jejich indikacemi v klinické praxi. Studenti jsou seznámeni s bezpečnostními pravidly práce v mikrobiologické laboratoři, metodami dezinfekce a sterilizace, fázemi mikrobiologického vyšetření (preanalytická, analytická a postanalytická fáze). Náplní předmětu jsou dále přehled a metody identifikace klinicky nejvýznamnějších bakterií v rámci speciální bakteriologie.