Cílem předmětu je studium metody hmotnostní spektrometrie z teoretického i praktického hlediska. To zahrnuje principy ionizačních technik, základy instrumentace v hmotnostní spektrometrii s důrazem na aktuální v ývoj zejména v oblasti ionizačních technik za atmosférického tlaku a tzv. „ambient“ ionizačních technik, vývoj na poli analyzátorů v hmotnostní spektrometrii, spojení hmotnostní spektrometrie se separačními technikami zahrnující kapalinovou a plynovou chromatografii a také kapilární elektroforézu.
Praktické znalosti zahrnují interpretaci spekter a práci s různými typy MS záznamů.