Cílem SDZ je ověřit připravenost studentů doktorského studia řešit bioanalytické problémy instrumentálními metodami. Důraz je kladen na optimální volbu metody a postupu vzhledem k povaze vzorku, a to na základě hlubokých znalostí podstaty, možností i omezení instrumentálních metod.
V oblasti chromatografických metod se jedná zejména o prohloubení znalostí v oblasti instrumentace k HPLC, uplatnění nových typů stacionárních fázi, nové trendy v kapalinov é chromatografii (UPLC), moderní typy detekce (hmotnostní spektrometrie, aj.). V oblasti elektroforetických metod je pozornost věnována současným trendům v miniaturizaci elektroforetických metod a jejich automatizaci.
Dále je předmětem SDZ ověření znalostí z problematiky úpravy biologického vzorku k analýze, ze současných trendů v automatizaci metod v klinické laboratoři, zvládnutí problematiky interpretace dosažených výsledků a problematiku validací metod pro analýzu biologicky aktivních látek.
Absolvent by měl mít také základní znalosti z oblasti analýzy látek ovlivňujících životní prostředí, z oblasti analýzy potravin, z oblasti metod toxikologické analýzy a z oblasti základních hematologických metod z pohledu bioanalýzy.