Systém organických sloučenin: uhlovodíky, halogenderiváty, alkoholy, fenoly, ethery, halogenhydriny, dusíkaté deriváty uhlovodíků, sloučeniny síry, křemíku fosforu a arsenu, karbonylové sloučeniny, karboxylové kyseliny a jejich deriváty, substituované karboxylové kyseliny a jejich deriváty, deriváty kyseliny uhličité, organokovové sloučeniny, heterocykly, syntetické polymery.
Systematika reakcí organické chemie:
Substituce radikálové, nukleofilní, elektrofilní, eliminace, adice elektrofilní, radikálové, nukleofilní, oxidace, redukce, přesmyky, degradace.
Přípravný předmět pro výuku profilových disciplín vyučovaných na fakultě, tematicky navazující na předmět Organická chemie I, je tedy předpokládána znalost systematického názvosloví organických sloučenin, jejich stereochemie a fyzikálních vlastností.