Metody populační biologie rostlin

Sylabus

Kurs má část teoretickou (přednášky, demonstrace analýzy dat a modelování), a část praktickou (analýza a modelování dat přinesených posluchači, nebo dat, která přinesou přednášející). Závěrem kursu posluchači vypracují krátký report o vybraném zpracovávaném problému, který přednesou a obhájí na společném sezení.

Náplň cyklu vychází z problémů a technik, které uvádíme v manuálu pro analýzu dat v populační biologii (Herben a Münzbergová: Zpracování geobotanických dat v příkladech - Část II. Demografická data). Obsah se mezi jednotlivými běhy trochu mění. Jednotlivé okruhy:

- analýza dat o natalitě a mortalitě: logistická regrese, analýza přežívání

- analýza dat o růstu rostlin

- analýza dat o kvetení, produkci semen, analýza dat z polinačních pokusů: Poissonovská regrese

- analýza dat o klíčení a přežívání semenáčků, analýza dat o přežívání semen v půdě

- identifikace jednosměrných vztahů v datových souborech pomocí parciální regrese a path analysis

- konstrukce populačních přechodových matic, kritika sebraných dat

- maticové modelování populační dynamiky: stabilní věková struktura, růstová rychlost, její variabilita, průměrná délka života

- elasticita, příspěvky jednotlivých fází k růstové rychlosti, zjišťování "kritických" fází

- spolehlivost predikcí maticových modelů

- metapopulační dynamika: stanovení parametrů křivky šíření, metapopulační kapacity

- metapopulační dynamika: modelování šíření druhu v krajině s explicitní strukturou

- analýza dat na úrovni populace

Anotace

Předmět je vyučován anglicky v případě přítomnosti zahraničních studentů.

Cílem praktika je podat přehled běžných postupů ve dvou oblastech:

? analýza běžných datových souborů v populační biologii rostlin

? použití základních technik pro modelování v populační biologii a jejich aplikace v praktických situacích

? seznámení s možným softwarovým vybavením pro práci v populační biologii (zejména Matlab a S-plus)