různé typy preparátů (trvalé, vitální, repliky) a jejich využití
fixace, dehydratace
zalévací média, infiltrace
2. Řezání rostlinných objektů v mikrotechnice
mikrotomy (ruční, rotační, sáňkové, kryotom)
nůž jeho údržba a použití
příprava ručních řezů
příprava parafínových řezů, nastavení mikrotomu
\"žehlení\" řezů a jejich lepení na sklíčka
3. Barvení preparátů (princip a metodika)
barviva (systém dělení, chemická povaha)
vazba barviva na cílovou strukturu
interpretace výsledků barvení
vybrané barvící postupy
4. Základy světelné mikroskopie a mikrofotografie
vysvětlení základních pojmů, složení mikroskopu
seřízení mikroskopu (Köhlerův princip)
údržba mikroskopu
některé techniky světelné mikroskopie
mikrofotografie.
5. Základní přehled histochemických metod v bot. mikrotechnice
co je a není histochemická detekce
kontrolní řezy, vliv předchozího ošetření (fixace)
interpretace získaných výsledků
vybrané postupy
6. Informace o možnostech editace a analýze obrazu
digitalizace obrazu a jeho parametry
editace digitálního obrazu (equalizace, filtrace,)
analýze obrazu (binární obraz, prahování, extrakce dat, dostupný software)
1. Slides
various kinds of slides (permanent, vital, surface replicas), their preparation and use
fixation, dehydration
embedding (used media, infiltration)
2. Cutting of plant objects
microtomes (hand, rotary, sliding, cryotom)
knive - its usage and maintenance í
free-hand sections
paraffin method - cutting sections, adjustment of the microtome
straightening, and mounting of sections
3. Dyeing of specimens (principle and methods)
dyes (system, chemical nature)
principles of dyeing
interpretation of results
selected dyeing procedures
4. Light microscopy and microphotography
basic terms, microscope setup
microscope adjustment (Köhler´s principle)
maintenance of microscope
techniques of light microscopy
microphotography
5. Selected histochemical methods in botanical microtechnique
what is and what is not histochemical detection
adequate control, influence of pretreatments (fixation)
interpretation of results
selected methods
6. Basics on image processing and analysis
digitalisation of the image and its parameters
processing of the image (equalisation, filtration)
image analysis (thresholding, binary image, data extraction, software)
1. Slides various kinds of slides (permanent, vital, surface replicas), their preparation and use fixation, dehydration embedding (used media, infiltration)
2. Cutting of plant objects microtomes (hand, rotary, sliding, cryotom) knive - its usage and maintenance í free-hand sections paraffin method - cutting sections, adjustment of the microtome straightening, and mounting of sections
3. Dyeing of specimens (principle and methods) dyes (system, chemical nature) principles of dyeing interpretation of results selected dyeing procedures
4. Light microscopy and microphotography basic terms, microscope setup microscope adjustment (Köhler´s principle) maintenance of microscope techniques of light microscopy microphotography
5. Selected histochemical methods in botanical microtechnique what is and what is not histochemical detection adequate control, influence of pretreatments (fixation) interpretation of results selected methods
6. Basics on image processing and analysis digitalisation of the image and its parameters processing of the image (equalisation, filtration) image analysis (thresholding, binary image, data extraction, software)
Course should provide overview of light microscopy, preparation of plant objects to microscope, acquisition and processing of image data from the microscope and selected histochemical procedures. Integral part of the course is practical training pointed to gaining of practical skills and understanding of the methods.