Časoprostorové modelování a simulace biologických systémů

Sylabus

Pokryté oblasti: i)               analýza prostorovosti ii)             příčinové diagramy iii)            vektorová pole iv)            částicové metody v)             rovnice difuze a toku vi)            hybridní metody počítačové simulace

Nedílnou součástí kurzu je studentský projekt zaměřující se na simulaci skutečného biologického systému.

Anotace

Modelování biologických systémů se stává stále populárnějším a důležitějším nástrojem k porozumění biologických mechanizmů. Souhra mezi experimentem, teorií a simulacemi poskytuje vhled do dynamického chování komplexních mnohasložkových biologických systémů, které nemohou být snadno uchopeny tradičními vědeckými přístupy.

Výpočetní přístupy tvoří jádro modelování a simulací biologických systémů. Kurz se zaměřuje na modelování technik časově rozlišených systémů.

Studenti se naučí brát v potaz geometrii systémů a transport v prostoru. Po opakování základní matematiky a fyziky se studenti naučí modelovat procesy jako difuze či tok a simulovat je na poočítači.