Moderní metody výzkumu proteinů

Sylabus

Chemické rekace proteinů, hmotnostní spektrometrie (MS), proteinové interakce, studium strukturních změn proteinů, chemické zesítění, vodík/deuteriová výměna, afinitní MS.

Anotace

Přednáška probírá některé moderní metody proteinového výzkumu se silným důrazem na strukturní a afinitní proteomiku. Podrobně jsou probírány kapitoly z proteinové chemie a modifikací proteinů, řešení proteinových interakcí a strukturních změn pomocí chemického sítění, vodík/deuteriové výměny, oxidativního značení a nativní hmotnostní spektrometrie. Dále je probíráno jak tato data bioinformaticky zpracovat do podoby strukturních modelů.

Před touto přednáškou je vhodné absolvovat kurz "Proteomika a metody studia primární struktury biopolymerů" (MC250P60N), který se věnuje základům biologické hmotnostní spektrometrie.

Přednáška, prezentace studentů i zkouška (sepsání kritického pojednání) probíhají v angličtině. K otevření kurzu je třeba alespoň 5ti zapsaných a aktivních studentů.