Chemie biochemicky významných peptidů a proteinů

Sylabus

Chemie biochemicky zajímavých peptidů a proteinů Seznam přednášek:

1. Úvod do struktury a vlastností aminokyselin, peptidů a proteinů (přednášející Lenka Žáková) - Struktura a vlastnosti aminokyselin, peptidů a proteinů, pKa, pI, reaktivita, funkční skupiny, Ramachandranův plot, hydrofobicita, aromaticita, chiralita, cis-trans atd.

2. Chemie a syntéza aminokyselin a jejich derivátů (přednášející Jiří Jiráček) - Chemická a enzymatická příprava derivátů aminokyselin

3. Chemická syntéza peptidů a proteinů - I (přednášející Jiří Jiráček) - syntéza peptidů a proteinů obecně a v roztoku, činidla, chránicí skupiny, cyklické peptidy, nativní ligace.

4. Chemická syntéza peptidů a proteinů - II (přednášející Lenka Žáková) - Syntéza na pevné fázi, úvod do SPS

5. Chemická syntéza peptidů a proteinů - III (přednášející Jiří Jiráček) - Syntéza na pevné fázi, speciální metody, automaty

6. Vedlejší reakce peptidů a proteinů (přednášející Lenka Žáková) - Např. chemická degradace, formace aspartimidů, štěpení, racemizace, modifikace specifickými činidly (CNBr, iodoacetamid, oxidace, redukce) atd.

7. Kombinatorická syntéza peptidů (přednášející Jiří Jiráček) - Syntetické peptidové knihovny a jejich použití.

8. Semisyntéza peptidů a proteinů (přednášející Lenka Žáková) - Využití přírodních molekul pro syntézu derivátů, enzymová semisyntéza

9. Peptidomimetika a proteomimetika (přednášející Jiří Jiráček) - Syntéza a využití látek mimikujících struktury a vlastnosti, např. také pseudopeptidy, peptoidy.

10. Chemické modifikace peptidů a proteinů (přednášející Lenka Žáková). - Cílené specifické značení, fluorescenční značení, radioaktivní značení.

11. Konjugáty peptidů a proteinů (přednášející Jiří Jiráček) - Biokonjugáty, crosslinky biomolekul, syntéza lipoproteinů, glykoproteinů, všechny "click" chemie využívané u  - peptidů.

12. Inteiny (přednášející Jiří Jiráček). - Vlastnosti inteinů a jejich využití

13. Peptidy a proteiny používané jako léčiva (přednášející Jiří Jiráček a Lenka Žáková) - Přehled lékařsky využívaných peptidů, proteinů a jejich derivátů, souhrn, závěr.

Anotace

Přednášky během podzimu 2021 budou přednášeny prezenčně v ÚOCHB ČAV v Dejvicích, Flemingovo nám. 2, 166 10 v učebně jež Vám bude specifikována emailem. Před každou přednáškou bude studentům emailem zaslána pdf verze přednášky.

V této sérii přednášek budou probrány chemické vlastnosti aminokyselin, peptidů a proteinů, způsoby jejich chemické syntézy, chemická příprava jejich derivátů a mimetik, kombinatorické metody syntézy a využití knihoven peptidů, specifické chemické modifikace a značení peptidů a proteinů, příprava a použití biokonjugátů peptidů a proteinů a přehled terapeuticky využívaných peptidů a proteinů.