Praktikum strukturní biologie

Sylabus

Krystalografie: krystalizace proteinů v různých podmínkách, vybírání krystalů a nastavení difrakce, zpracovaní difračních dat, fitování struktury do elektronové hustoty.

NMR: příprava titrační řady ke sledování proteinové interakce, snímání dat na spektrometru, vyhodnocení vazby k proteinu, přiřazení rezonancní lavního řetězce.

Vyhodnocení strukturních dat, proteinová strukturní databáze, hledání strukturně podobných proteinů, predikce sekundární struktury, práce s programy pro zobrazování struktur biomolekul.

Anotace

Praktikum je určeno primárně pro studenty magisterského a doktorského studia. Cílem praktika je seznámit studenty s technikami strukturní biologie (biomolekulární krystalografií a NMR spektroskopií). Praktikum je turnusové a bude probíhat na Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR v posledním týdnu semestru nebo prvním týdnu zkouškového období dle možností zapsaných studentů.

Před praktikem je výhodou znalost základů technik NMR a proteinové krystalografie, např. předměty Biofyzikální chemie I a II, Řešení trojrozměrné struktury makromolekul.

Pokud bude naplněna kapacita a nebude možné si praktikum zapsat, zvážíme její navýšení. Kontaktujte mě přes email: [e-mail]