Předmět je zaměřen na metody molekulárního modelování, včetně příslušného software. Učivo zahrnuje tvorbu molekulárních modelů a jejich využití ve výuce.
Těžištěm předmětu je modelování struktury a reaktivity organických sloučenin. Manipulace s molekulárními modely směřuje k jejich využití při řešení různých problémů, např. prezentace fenoménu konjugace, substitučního efektu, mechanizmu reakcí apod.