Po odevzdání dokončené BC práce se student musí přihlásit k její obhajobě. Vlastní průběh obhajoby se skládá s prezentace tématu, typu výzkumu, popřípadě použitých metod, které vedly k zajištění výsledků, následuje interpretace výsledků s návrhem závěrů.
Délka prezentace se pohybuje v rozmezí 15 až 20 minut. Následně si student a komise poslechne posudky od vedoucího a oponenta práce, po nichž odpoví na jejich položené otázky, popřípadě reaguje na otázky ostatních členů komise.
Po zodpovězení všech otázek, je student požádán, aby opustil místnost pro obhajobu a komise se porad í, zda student svou práci obhájil a navrhne stupeň hodnocení. Následně je student přizván zpět do místnosti a předsedou komise je mu sděleno, na čem se komise dohodla.
Jsou li v práci shledány určité nedostatky, může být studentovi doporučeno, aby některé části práce upravil v erratech, které musí dokončit do předem stanoveného termínu.