Základní pojmy epidemiologie a molekulární epidemiologie. Typy studií, pojem prevalence, incidence, mortalita, morbidita, principy využití molekulární epidemiologie ve virologii, průkaz etiologické souvislosti virové infekce s onemocněním, eradikace onemocnění, epidemie, pandemie.
Laboratorní metody. Přehled diagnostických metod používaných pro rutinní praxi a jejich principy, odběr klinických vzorků, transport, preanalytická fáze zpracování klinických materiálů, správná laboratorní praxe (např. externí hodnocení kvality, akreditace laboratoří, doporučení), citlivost, specificita, PPV, NPV, RLU křivka, analytická citlivost, klinická citlivost diagnostických testů, in vitro diagnostika a spolehlivost komerčních setů.

Patogeneze virových onemocnění
HBV, HAV, HCV, a další viry vyvolávající hepatitidy
Herpetické viry - HSV1,2, CMV, EBV, HHV6, HHV8, VZV
Chřipka a další respirační viry
HIV, HPV
Virové gastroenteritidy - rotaviry, noroviry, astroviry
Rubeolla, příušnice, spalničky

Zoonózy - virus vztekliny, virus chřipky savců a ptáků, paramyxoviry, anelloviry
Hospodářsky významné virové infekce zvířat - pestiviry, virus slintavky a kulhavky, virus Newcastelské choroby ptáků, herpesviry zvířat
Retroviry zvířat, circoviry, parvoviry, coronaviry