1. Základy laboratorní práce

Teoretická část:

- bezpečnost, vážení/měření, zásady správného pipetování, představení základního laboratorního vybavení (centrifugy – vyvážení, RPM/g, flowbox, atd.), zásady sterilní práce

Praktická část:

- výpočty: převody jednotek, objemová koncentrace, molární koncentrace

- příprava roztoků – ředění, úprava a měření pH

- příprava růstových médií a ploten

2. Technika a barvení suchých nátěrů, manipulace s laboratorní myší

Teoretická část:

- parazitičtí prvoci přenášení hmyzem; použití laboratorních zvířat v parazitologii a mikrobiologii

Praktická část:

- krevní roztěr infekcí Trypanosoma brucei, Plasmodium berghei

- tlustá kapka - diagnostika Plasmodium berghei

- barvení suchých nátěrů metodou Giemsy-Romanowského, rychlé barvení Dade Diff-Quik

- manipulace s laboratorní myší, nácvik IP inokulace

3. Klonování, kvantitativní práce s prvoky

Teoretická část:

- růst mikrobiálních kultur; růstová křivka, výpočet generační doby; metody klonování, colony-forming efficiency

Praktická část:

- práce s Burkerovou počítací komůrkou

- výpočet množství buněk

- manipulace s tekutými médii, nácvik pasážování kultur

- izolace klonů metodou mezního ředění (Trichomonas vaginalis)

4. Kultivační techniky

Teoretická část:

- typy mikrobiálních kultur; složky kultivačních médií; postupy při kryoprezervaci prvoků

Praktická část:

- vyhodnocení klonovacího pokusu

- axenizace prvoků, výroba migrační rourky

- zmražovací techniky, kryoprezervace prvoků, demonstrace kryobanky

5. Koprologie

Teoretická část:

- zásady sběru materiálu, hygiena, pomůcky, kalibrace okuláru, přehled metod

Praktická část:

- koprologické vyšetření pomocí flotace, sedimentace, larvoskopie

6. ELISA

Teoretická část:

- princip, využití v diagnostice

Praktická část:

- test na přítomnost protilátek proti Toxoplasma gondii

7. Nukleové kyseliny I

Teoretická část:

- struktura DNA (párování bazí), princip izolace DNA pomocí silikátové kolony, princip izolace DNA/RNA pomocí TRIzol Reagent, kontrola integrity RNA

Praktická část:

- izolace DNA – silikátové kolony

- precipitace DNA

- stanovení koncentrace DNA

8. Nukleové kyseliny II

Teoretická část:

- princip PCR, modulace PCR (nested PCR, RT-PCR, q-PCR, multiplex PCR), princip Sangerovy sekvenace

Praktická část:

- příprava reakce PCR, nastavení thermo cycleru

- gelová elektroforéza

- extrakce DNA z gelu

9. Rekombinantní proteiny I

Teoretická část:

- princip exprese cizorodého proteinu v bakteríální buňce, princip proteinové elektroforézy SDS PAGE

Praktická část:

- kryoprezervace bakterií

- elektroforetické stanovení proteinového profilu bakteriální kolonie pomocí – SDS PAGE (test solubility proteinu)

10. Rekombinantní proteiny II

Teoretická část:

- izolace rekombinantního proteinu za nativních a denaturujících podmínek, princip izolace proteinu značeného histidinovou kotvou

Praktická část:

- izolace rekombinantního proteinu pomocí afinitní chromatografie (His-Tag)

- stanovení koncentrace rekombinantního proteinu

11. Hmotnostní spektrometrie, imunoblot

Teoretická část:

- využití hmotnostní spektrometrie při analýze biologických vzorků (diagnostika, identifikace rekombinantních proteinů, analýza proteomu), příprava vzorku na analýzu

- imunoblot – diagnostické využití, identifikace rekombinantních proteinů

Praktická část:

- imunoblot – identifikace proteinu značeného histidinovou kotvou