1 Definice a vymezení oboru, základní pojmy, zdroje a faktory prostředí, reakční křivky, nika.

2 Vnitrodruhové a mezidruhové vztahy.

3 Biodiverzita: kvantifikace (úrovně a indexy), nerovnoměrné prostorové rozložení biodiverzity na globální, kontinentální a regionální úrovni a jeho příčiny.

4 Teorie ostrovní biogeografie, ostrovní gigantismus/nanismus, genetická diverzita ostrovů a s tím spojené problémy (inbreeding, efekt zakladatele), metapopulace, aplikace teorie ostrovní biogeografie v ochraně přírody.

5 Populační modely (exponenciální, logistický, model mezidruhové konkurence, model predátor-kořist), životní cykly druhů, demografické populační tabulky, křivky přežívání.

6 Společenstvo - faktory a hodnocení jeho diverzity, změny ve společenstvu (denní cykly, fenologie).

7 Tok a přeměna energie ve společenstvu, potravní řetězce, NPP, GPP a jejich prostorové gradienty, bioakumulace.

8 Ekosystém, typologie (zonální, azonální), znaky fungování ekosystému, resistence a resilience, zpětné vazby.

9 Sukcese, chronosekvence, modely sukcese, r/K strategie a jejich dynamika během sukcese, disturbance a jejich dopady na ekosystémové služby.

10 Oceánský biocyklus - ekologické členění a specifika ekologických zákonitostí.

11 Interakce člověka a ekosystémů - NPP appropriation, invazní druhy, ekosystémové služby.