1) Paleoantropologie a evoluční antropologie, archeologie a paleoekologie, modely v evoluční antropologii, primátologie a evoluční antropologie, fosilní doklady o evoluci vyšších primátů, paleontologické a neontologické doklady, význam genetických studií pro evoluční antropologii.
2) Teoretické aspekty fylogeneze vyšších primátů a základní adaptivní mechanismy, adaptivní strategie vyšších primátů, životní formy a speciace, základní přehled fylogeneze primátů a otázka vzniku hominidů, paleoekologie a stratigrafie ve fylogenezi primátů, základní ekologické události a adaptivní a exaptivní radiace a kolonizace jednotlivých regionů ve fylogenezi vyšších primátů
3) Vznik primátů a teorie evoluce primátů, fylogeneze primátů v paleogénu, Archiprimates a raní primáti, vznik vyšších primátů - asijští eocéní Anthropoidea - nejstarší vyšší primáti, nejstarší formy hominoidů, význam naleziště Fayum, nové nálezy z arabského poloostrova a jihovýchodní Ázie, adaptivní radiace svrchně oligocéních primátů - Parapithecidae a Propliopithecidae, fylogeneze nejstarších antropoidních primátů, vznik lidoopů a opic, nejstarší hominoidi a jejich adaptivní radiace.
4) Evoluce hominoidů na přelomu oligocénu a miocénu, fylogenetická pozice rodu Aegyptopithecus, adaptivní radiace hominoidů ve spodním miocénu ? Procosulini a Afropithecini, Proconsulinae a Victoriapithecinae - diversita spodně miocéních primátů a vznik a vývoj středně miocénních hominoidů a jejich adaptivní radiace - velikostní a drhuhová diversita spodně miocénních hominoidů.
5) Evoluce primátů ve středním miocénu - Kenyapithecus, sivapitéci a ?ramapitéci?, Keanyapithecus jako předek pokročilých hominioidů, evoluce hominoidů v Africe, Asii a Evropě -adaptivní radiace primátů ve svrchním miocénu, pliopitéci a oreopithéci, základní rozdíly mezi spodně a středně miocéními a svrchně miocéními hominoidy, fylogenetická pozice sivapitéků, Dryopithecus nové názory na jeho rozšíření a význam ve fylogenezi primátů, Ouranopithecus jako předek hominidů
6) Vznik pokročilých hominoidů, vznik hominidů, jejich diverzita a nejstarší nálezy hominidů, lidoopi a nejstarší Homininae, základní znaky hominidů a mechanismy hominizačního procesu, biologické, biosociální a sociální faktory hominizace, bipední lokomoce, její adaptivní a ekologický význam, ekologické modely evoluce hominidů.
7) Nejstarší australopitéci a jejich první adaptivní radiace, ancestrální a pokročilé znaky nejstarších australopitéků, bipedie a encefalizace prvních australopitéků, systematika a rozšíření nejstarších hominidů, doklady pro bipedii a encefalizaci, Orrorin tugenensis a Australopithecus (Ardipithecus) ramidus a jejich fylogenetická pozice, evoluce hominidů ve mio-pliocénu a spodním pliocénu. Diversita a adaptace archaických australopitéků (A. anamensis, A. afarensic, Kenyanthropus)
8) Druhá adaptivní radiace hominidů - vznik ?robustních? australopitéků a rodu Homo ekologické a evoluční hypotézy, nejstarší robustní australopitéci - Australopithecus aethiopicus a jeho fylogenetická pozice, robustní a gracilní australopitéci - podobnosti rozdíly, vznik rodu Homo ve středním pliocénu, první kamené nástroje, australopitéci a rod Homo - základní charakteristiky a diferenciace, hlavní příčiny a faktory jejich diversity.
9) Fylogeneze rodu Homo - základní znaky rodu Homo a jejich vývoj, fylogenetický význam Australopithecus garhi, systematika raných forem rodu Homo, Homo habilis a Homo rudolfensis, Homo ergaster a Homo erectus, Homo erectus ve spodním paleolitu a jeho diferenciace, Homo heidelbergensis nebo archaický Homo sapiens, modely vývoje rodu Homo - multiregionální a ?Out of Africa? modely, evoluce velikosti těla, proporcí a encefalizace u rodu Homo.
10) Evoluce velikosti těla a základních proporcí raných hominidů, sexuální dimorfismus a základní ekologické parametry raných hominidů, encefalizace a potravní adaptace raných hominidů, ekologie lidoopů a opic jako model pro rekonstrukci ekologie raných hominidů, postavení hominidů v ekosystémech v jednotlivých fázích evoluce hominidů
11) Lidoopi a hominidé, nové poznatky o chování a sociální struktuře lidoopů, možnosti jejich využití při poznávání evoluce hominidů, analogie mezi lidoopy a člověkem biomechanika, morfologie, etologie, výzkum lidoopů v zajetí a ve volné přírodě, schopnosti lidoopů a jejich reálné možnosti, genetická příbuznost lidoopů a člověka - specifické rysy variability genomu lidoopů
12) Paleoantropologie a behaviorální ekologie, základní ekologické adaptace hominidů, ekologické aspekty fylogeneze hominidů, adaptivní radiace primátů v pliocénu a ve spodním pleistocénu, primatologické modely hominizačního procesu. Evoluce materiální kultury a její význam, kulturní adaptace hominidů, synergismus faktorů hominizačního procesu, evoluce sociálních vzorců chování
13) Paleogenetika – výzkum prehistorických populací, metody získávání DNA z kostry, genetika archaického Homo sapiens, moderní formy člověka a jejich příbuznost se současnými populacemi, význam starobylých genetických příměsi v genomu současného člověka,
Přehled teorií fylogeneze hominidů, evoluční versus fylogenetická systematika a teorie fylogeneze, nové názory na vznik a vývoj raných hominidů, teoretické názory na příčiny vzniku a vývoj rodu Homo, evoluční antropologie a molekulárně antropologické doklady o evoluci hominidů. Kolonizace světa hominidy - jednotlivé etapy kolonizačních vln, biogeografie kolonizace a diversita hominidů a paleontologické doklady, perspektivy evoluční antropologie a paleoantropologie.