* Základní osnova kurzu:

1. Úvod do problematiky, návaznost na předmět „základy ekologie“; důležitost globální ochrany biodiverzity na všech úrovních.
2. Rozšíření základních biomů na Zemi, I. část; ekologická charakteristika, vlajkové druhy organismů; využívání a přeměna stávajících ekosystémů člověkem.
3. Rozšíření základních biomů na Zemi, II. část; ohrožení jednotlivých biomů exploatací přírodních zdrojů.
4. Biogeografické členění České republiky. Příslušnost území České republiky do světových biomů a vegetačních pásů Evropy; obecné rysy přírody České republiky a vertikální zonace území České republiky.
5. Funkce vegetace v ekosystémech a v krajině. Mimoprodukční funkce dřevin. Rozptýlená zeleň v krajině; městská zeleň a její funkce v intravilánu obcí a měst, památné stromy a jejich ochrana. Funkce “mrtvého” dřeva z hlediska ochrany biodiversity (doupné stromy, loggery). Dřeviny z hlediska člověka “nežádoucí”.
6. Lesy v České republice. Produkční, mimoprodukční funkce lesů a jejich kategorizace. Lesy ochranné, zvláštního určení a lesy hospodářské. Příčiny změn druhové skladby lesů. Hlavní problémy současných lesů. Pionýrské, meliorační a zlepšující dřeviny.
7. Mokřady v České republice - význam mokřadů z hlediska ekologie krajiny, ochrany biodiverzity a ochrany stanovišť. Kategorizace mokřadů v České republice, jejich výskyt, využívání a potenciální ohrožení, možnosti ochrany.
8. Uměle vzniklé mokřady a jejich význam v krajině. Exploatované lokality v krajině a jejich význam pro vznik nových mokřadních biotopů. Integrované mokřady, protipovodňové poldery, kořenové čistírny a „koupací“ biotopy.
9. Lužní lesy a jejich nadregionální význam. Výskyt lužních lesů na území České republiky v historii a dnes; ekosystémové služby mokřadů, jejich exploatace a ohrožení, možné způsoby ochrany.
10. Bezlesé biotopy obecně. Historický původ nelesních biotopů v naší krajině. Primární a sekundární bezlesí. Kategorizace bezlesí. Biotopy skal. Obecná charakteristika suchých stanovišť.
11. Stepi a lesostepi v České republice, jejich význam a ohrožení. Stávající ochranářský management těchto biotopů. Problematika pastvy v ochranářském managementu.
12. Biotopy hor. Výskyt, význam a ohrožení horských biotopů. Nárůst významu hor pro člověka a jejich vzrůstající exploatace. Základní kategorizace biotopů vyskytujících se v horách České republiky.
13. „Nová divočina“, „brownfields“ a „vesnická humna“ jako specifické antropogenní biotopy. Jejich vznik, význam a možné využití. Agrocenózy jako specifický biotop kulturních rostlin a navazujících organismů.

* Povinná literatura:

PRACH, Karel ‒ ŠTECH, Milan ‒ ŘÍHA, Pavel. Ekologie a rozšíření biomů na Zemi. 1. vyd. Praha: Scientia, 2009. 152 s. ISBN 978-80-86960-46-3.
SÁDLO, Jiří ‒ STORCH, David. Biologie krajiny (biotopy České republiky). 1. vyd. Praha: Vesmír, 2000. 94 s. ISBN 80-85977-31-1.
MIKO, Ladislav ‒ HOŠEK, Michael (eds.). Příroda a krajina České republiky. Zpráva o stavu 2009. 1. vyd. Praha: Agentura ochrany přírody a krajiny České republiky, 2009. 112 s., ISBN 978-80-87051-70-2.
CHYTRÝ, Milan ‒ KUČERA, Tomáš ‒ KOČÍ, Martin ‒ GRULICH Vít ‒ LUSTYK, Pavel (eds.). Katalog biotopů České republiky. 2. vyd. Praha: Agentura ochrany přírody a krajiny ČR, 2010. 445 s. ISBN 978-80-87457-03-0.
MLÍKOVSKÝ, Jiří ‒ STÝBLO, Petr (eds.). Nepůvodní druhy fauny a flóry České republiky. 1. vyd. Praha: Agentura ochrany přírody a krajiny ČR, 2006. 496 s. ISBN 80-86770-17-6.

* Doporučená literatura:

PYŠEK Petr ‒ SÁDLO Jiří, MANDÁK, Bohumil. Catalogue of alien plants of the Czech Republic. Preslia, The Journal of the Czech Botanical Society, 2002. vol. 74, pp. 97-186. ISSN 0032-7786.
NĚMEC, Jan ‒ POJER, František (eds.). Krajina v České republice. 1. vyd. Praha: MŽP ČR, Consult Praha, 2007. 400 s. ISBN 80-903482-3-8.
SCHAMA, Simon. Krajina a paměť. 1. vyd. Praha: Dokořán, 2007. 720 s. ISBN 978-80-7203-803-9.
VAN ANDEL <http://eu.wiley.com/WileyCDA/Section/id-302479.html?query=Jelte+van+Andel>, Jelte ‒ ARONSON <http://eu.wiley.com/WileyCDA/Section/id-302479.html?query=James+Aronson>, James (eds.). Restoration ecology: The new frontier, 2nd ed. Chichester: Wiley-Blackwell, 2012. 400 p. ISBN: 978-1-4443-3635-1.
JENÍK, Jan. Ekosystémy: Úvod do organizace azonálních biomů. 2. vyd. Praha: Karolinum, 1998. 135 s. ISBN 80-7184-040-8.

DEMEK, J. (1988): Obecná geomorfologie. Praha : ČSAV, 476 s.