Absolvent studijního programu je odborníkem schopným provádět standardní terénní i teoretické ekologické analýzy populací a společenstev i kvantitativní interpretaci ekologických dat. Absolvent má dobré předpoklady pro navazující magisterské studium v biologických studijních programech i v příbuzných programech přírodních věd.

Současně se dobře uplatní na pracovištích základního i aplikovaného výzkumu, v institucích a firmách zabývajících se pěstováním rostlin a chovem živočichů, v oblastech muzeologie, zoologických a botanických zahradách i v nevládním a soukromém sektoru zabývajícím se problematikou ekologické biologie a biodiverzity (ochrana přírody, kontrola kvality vod, revitalizační zásahy).