Studijní program Patologie zahrnuje především tyto okruhy: korelace morfologických a molekulárně biologických vlastností nádorů s důrazem na využití v diferenciální diagnostice, metody detekce virových a bakteriálních patogenů v karcinogenezi, problematiku nádorů měkkých tkání, hlavy a krku, slinných žláz, plic, krvetvorby a gastrointestinálního traktu s důrazem na charakteristiku nových jednotek. Doktorand se zaměřuje na řešení konkrétního výzkumného tématu, které je v souladu s výzkumným zaměřením školícího pracoviště.

V průběhu studia získá nejen široký teoretický základ z oboru patologie, ale podle konkrétního zaměření studijního plánu hlubší znalosti metodické, především technik molekulárně biologických a imunohistochemických.