Vliv DPH na DPPC-Cholesterolové membrány s různou koncentrací cholesterolu: Od lokálních perturbací až po omezení ve fluorescenčních anizotropních experimentech
Abstrakt
Použili jsme atomární molekulární dynamické simulace zahrnující 1,6-diphenyl-1,3,5-hexatriene (DPH) fluorescenční sondu v kapalné dipalmitolfosfatidylcholinové dvouvrstvě s 5 a 20 mol % cholesterolu (CHOL). Ukázali jsme, že zatímco DPH postihuje mnoho membránových vlastností, perturbace způsobené DPH závisí na koncentraci cholesterolu v membráně.
Například, nalezli jsme že DPH ovlivňuje rozdělení hustoty lipidů napříč membránou a podporuje uspořádání acylových řetězců kolem sondy. Nicméně, tyto odchylky jsou relativně slabé pro vzrůst koncentrace cholesterolu.
Nicméně, rovněž jsem zjistili, že obecně používané analýzy v podmínkách modelu Brownovy rotační difuze s Legendrovými polynomy k interpretaci fluorescenčních anizotropn ích (FA) experimentů jsou citlivé na množství cholesterolu. Pro malé koncentrace cholesterolu dává analýza dobrou aproximaci orientační distribuce DPH.