Zásadní příspěvek J. E.
Purkyně v oblasti rostlinné fyziologie, dílo De cellulis antherarum fibrosis ..., obsahuje několik originálních konceptů a pozorování - např. morfologie prašníků, koncept nitkových buněk a zavedení pojmů "endothecium" a "exothecium". Obecně Purkyňovy práce o rostlinách, ač nenápadné, dokládají, že nebyl jen fyziologem či histologem živočichů, ale že jeho skutečný zájem byl mnohem obecnější a odvážnější: pochopit nejzákladnější principy života pomocí zkoumání klíčových procesů pohybu a rozmnožování ve vztahu ke struktuře živých těl.