Léčba peptických vředů gastroduodena se odvíjí od etiologie a klinické situace, tj. přítomností či nepřítomností komplikace či zda se jedná o rekurující či refrakterní ulceraci.Iniciální terapie se liší u stabilního pacienta s dyspepsií a u nemocného s krvácejícím vředem. V současné době u osob s peptickou ulcerací převládá léčba medikamentózní (cílem je potlačit tvorbu kyselé žaludeční sekrece a eradikovat případnou infekci Helicobacter pylori).
Chirurgická terapie je indikována pouze při závažných komplikacích (vyjímečně z jiné indikace). Při krvácení se uplatňuje v naprosté většině případů léčba endoskopická,v případě jejího selhání intervence vazografická nebo chirurgická.