Autologní materiál je v kofochirurgii ve většině indikací upřednostňován před materiálem aloplastickým či homologním. Výjimečné postavení při volbě materiálu k rekonstrukci převodního systému mají pacienti s cholesteatomem.
U těchto pacientů není doporučováno využití autologní středoušní kůstky pro riziko perzistence cholesteatomu.