Idiopatické střevní záněty jsou multifaktoriální onemocnění. Základní onemocnění je Crohnova nemoc a ulcerózní kolitida.
Crohnova nemoc postihuje celý trávicí trakt, ale nejčastěji postihuje tenké a tlusté střevo. Ulcerózní kolitida nepostihuje tenké střevo, ale je omezena na rektum a tračník.