Somatická onemocnění mohou svojí podstatou nebo příznaky redukovat trvání a nebo způsobit nekvalitní strukturu nočního spánku.Insomnie může tak být symptomem těchto nemocí (obstrukční a centrální spánková apnoe, narkolepsie, poruchy cirkadiánního rytmu, syndrom neklidných nohou, křeče v dolních končetinách ve spánku a bruxismus ve spánku) a nebo jejich komorbiditou.