Dějiny péče o písemnosti produkované univerzitou v pobělohorském období, jednak těch pocházejících z tzv. světských fakult, právnické a lékařské, jež jsou nyní uchovávány v Archivu Univerzity Karlovy, ale zejména těch, které pocházejí z fakult duchovních, filozofické a teologické, které tvoří součást fondu Jesuitika ve Státním ústředním archivu v Praze.