Strukturální a funkční změny na úrovni mikrocirkulace jsou patofyziologickým mechanismem vývoje řady závažných onemocnění včetně sepse a ostatních forem distributivního šoku. Intenzivní rozvoj výzkumu patofyziologických zákonitostí a vztahů na úrovni mikrocirkulace, s možností jejího on-line zobrazení v experimentu i klinické praxi, přinesl řadu nových poznatků, jejichž interpretace a možnosti vzájemného srovnání jsou velmi obtížné z důvodu nejednotných metodik nových klinických studií.
Standardizace metod vizualizace a analýzy mikrocirkulace je zaměřena na výběr míst pro vyšetření mikrocirkulace, na maximální eliminaci tlakem indukovaných artefaktů, na adekvátní zaostření, kontrast a kvalitu obrazu a na používání jednotných semikvantitativních skórovacích systémů při vyhodnocování mikrocirkulace. Na úrovni experimentálního i klinického výzkumu je věnována pozornost preexistujícím onemocněním s potenciálním vlivem na strukturu a funkci mikrohemodynamiky.