Význam screeningu v gastroenterologii se mění s ohledem na technologický vývoj metodik v laboratorní diagnostice. Screening kolorektálního karcinomu, který je druhou nejčastější malignitou v Evropě je nyní umožněn kvantitativní imunochemickou analýzou hemoglobinu ve stolici (FIT) s přesností téměř 95%.
Celiakie ovlivňuje téměř 1% populace, ale zůstává velmi často nediagnostikována. Doporučenou metodou pro cílený screening je nyní kombinace protilátek IgA tTGA a IgG DGP.
Diskutována je nyní otázka screeningu atrofické gastritídy při infekci Helicobacter pylori s rizikem rozvoje karcinomu žaludku. Specifickými markery stavu žaludeční sliznice jsou především pepsinogeny I a II, resp. jejich vzájemný poměr.
Detekce stabilního izotopu uhlíku 13C v dechovém testu 13C-UBT se značenou močovinou je při spolehlivosti nad 95% považována za zlatý standard v diagnostice infekce Helicobacterem pylori. Stanovení calprotectinu ve stolici je dalším screeningovým testem, který je nyní zvažován pro specifický screening v indikaci kolonoskopií při podezření na IBD, především u dětských pacientů.