Lykopen je dominujícím karotenoidem v rajčatech a představuje i převládající karotenoid lidské plazmy, v níž se vyskytuje ve větším množství než β-karoten a další dietní karotenoidy. Hlavním zdrojem pro člověka jsou rajská jablka a především výrobky z nich (omáčka, kečup, protlak apod.), kde se nalézá v množství 5-150 mg/100 g.
Vzhledem k jeho lipofilním vlastnostem zlepšuje jeho vstřebávání a využití tepelná úprava za přítomnosti tuku. Má silné antioxidační účinky a je považován za látku působící v prevenci především karcinomu prostaty, prsu, ale i kardiovaskulárních onemocnění.