Medicina založena na důkazech potvrdila, že antidepresiva jsou účinná v lečbě deprese, ale dodnes není zřejmé, jaké antidepresivum bude nejlepší pro kterého pacienta. Výsledky EEG studii ukazuji, že po jednom týdnu léčby antidepresivem můžeme správně předpovědět, že 8 z 10 pacientů nedosáhne odpovědi na léčbu, pokud bude ve stejné léčbě antidepresivem pokračováno dalších 3-7 týdnů.
EEG může pomoci ve volbě správného antidepresiva obdobně jako mikrobiologické vyšetření pomáhá zvolit správné antibiotikum.