Chronická tromboembolická plicní hypertenze (CTEPH) vzniká při postupné obstrukci plicních cév organizací trombů v lumen tepen po embolii plicnice a při remodelaci plicních arteriol v perfundovaných oblastech. Výsledkem těchto změn je postupný vzestup tlaků v plicnici, zvýšení plicní cévní rezistence a v dlouhodobém pohledu pravostranné srdeční selhání.