Relativně častou poruchou imunitních funkcí pacientů jsou sekundární imunodeficience. Vznikají na podkladě primárního onemocnění nebo aitrogenně jako následek jeho terapie.
Jejich nejčastějším projevem jsou recidivující infekce. Základem léčení je ovlivnění primární příčiny dysfunkce imunitního systému.