Kloakální malformace jsou vrozená onemocnění močového, pohlavního a trávicího ústrojí, která vznikají chybným vývojem kloaky a patří do skupiny anorektálních malformací. Postiženy jsou močová trubice, pochva a konečník, které nejsou od sebe odděleny, ale ústí společně tzv. kloakálním kanálem mezi malé stydké pysky.