Metodika popisuje přesné pokyny k monitoringu 42 druhů epifytických, epixylických a saxikolních mechorostů. Pro každý z těchto druhů byla na základě revize herbářového materiálu, excerpce literatury a terénního ověření části lokalit vytvořena samostatná mapa recentního a historického rozšíření.
Ke každému druhu byla vypracována samostatná karta obsahující informace o biologii, ekologii, rozšíření a ohrožení konkrétního druhu. Karty druhů byly připojeny jako příloha k metodice.
Metodika dále obsahuje dva formuláře, do nichž je doporučeno data z monitoringu zaznamenávat.