Církev v Arménii patří k nejstarším na světě. Důležitým zlomem v dějinách arménských křesťanů byl Chalkedonský koncil (451), jehož christologické závěry Arméni nepřijali.
Tím bylo přerušeno jak communio s Římem, tak i s Konstantinopolí. Území Arménů padlo do rukou muslimů a později bylo rozděleno mezi perskou a osmanskou říši. Oba nástupnické státy, Rusko, resp.
Sovětský svaz. a Turecko Armény pronásledovaly a vyvrcholením tohoto útisku byla jejich genocida v Turecku mezi lety 1894 a 1915. Právě v tomto období zaniklo třináct starobylých eparchií arménské katolické církve.
Dnes arménská katolická církev jurisdikčně podléhá částečně kilíkijskému patriarchovi a částečně přímo římskému papeži.