Terapie idiopatických střevních zánětů je velkou výzvou pro současnou gastroenterologii. Ve světle nových vědeckých poznatků dochází i k vývoji nových léčiv či léčebných postupů.
V posledních letech se do běžné klinické praxe dostávají aminosalicyláty a kortikosteroidy využívající multimatrixovou technologii. Objevují se nová biologická léčiva (biologika) a díky vývoji biosimilárních léčiv (biosimilars) se biologická léčba stává dostupnější.
Zároveň stále probíhá výzkum alternativních metod léčby, jakou je např. fekální bakterioterapie.