Volba antibiotik v prostředí narůstající rezistence původců bakteriálních infekcí vyžaduje vysoce zodpovědný přístup. Důvodem je jak dosažení spolehlivého účinku, tak i prevence dalšího šíření rezistence.
Nezbytným podkladem pro empirické podání jsou aktuální přehledy rezistence, optimálně pak identifikace a stanovení citlivosti konkrétního patogena pro cílenou léčbu. Výběr vhodných přípravků pro léčbu komunitních infekcí (uroinfekcí) by měl respektovat národní doporučení, terapie nemocničních infekcí pak vycházet z lokálních epidemiologických podmínek.
Pro léčbu infekcí vyvolaných multirezistentními mikroorganismy je perspektivních v současné době několik přípravků (ceftolozan/tazobaktam, ceftazidim/avibaktam, pivmecilinam).