Onemocnění covid-19, které se stalo celosvětovou pandemií, je způsobeno novým koronavirem s názvem SARS-CoV-2. Koronaviry jsou velká skupina obalených jednovláknových RNA virů.
Některé způsobují respirační infekce u lidí, zatímco jiné způsobují onemocnění u určitých druhů zvířat, jako je například skot, velbloudi a netopýři. Současné důkazy naznačují, že virus SARS-CoV-2 je původem ze zvířecího zdroje.
Data z genetických sekvencí odhalují, že virus SARS-CoV-2 je blízkým příbuzným jiných koronavirů, které cirkulují v populaci vrápenců (Rhinolophus). K dnešnímu dni však není k dispozici dostatek vědeckých důkazů k identifikaci zdroje viru nebo k vysvětlení původní cesty přenosu na člověka, která mohla zahrnovat přechodného hostitele.