Nedílnou součástí konzultace před cestou do zahraničí bývá otázka očkování. V dětském věku je význam vakcinace před výjezdem větší než u dospělých, protože děti jsou na cestách ve zvýšené míře ohroženy komplikacemi infekčními i neinfekčními.
Volba doporučovaných očkování závisí především na rizicích v dané destinaci, na věku dítěte a jeho zdravotním stavu. Je nutné ověřit dosud proběhlá povinná očkování a doplnit chybějící z ákladní vakcinaci.
Dalším krokem je doporučení vhodných "nepovinných" očkování, která jsou běžně do českého očkovacího kalendáře zařazována, například vakcinaci proti pneumokokovým a rotavirovým infekcím či varicele. Podle konkrétních rizik v dané destinaci jsou indikována i "cestovatelská" očkování; nejčastěji se aplikují vakcíny proti hepatitidě A, vzteklině, meningokokovým infekcím a další.
Vždy je třeba zohlednit věk dítěte, protože některé vakcíny jsou u nejmladších dětí kontraindikované (žlutá zimnice), nebo jsou neúčinné (polysacharidová vakcína proti břišnímu tyfu).