Určení podobnosti mezi dvěma proteinovými strukturami je jedním z nejdůležitějších problémů současné strukturní bioinformatiky. S rostoucí komplexností podobnostních měr roste také jejich efektivita.
Avšak jiné důležité charakteristiky, jako například stupeň splnění metrických vlastností, se mohou spíše zhoršit než zlepšit. V tomto článku představíme efektivní míru a budeme studovat, v jaké míře splňuje různé metrické vlastnosti.