Konformace DNA a její sekvenční preference

Abstrakt

Geometrická struktura fosfátové báze byla analyzovaná pro vzorek 7739 dinukleotidů pocházejících z 447 vybraných krystalových struktur DNA. Deset torzních úhlů měřených na dinukleotidech je klasifikováno pomocí Fourierovy transformace a následné shlukové analýzy.

Možné sekvenční preference důležité pro klasifikaci DNA podle konformačních skupin jsou analyzovány pomocí statistických testů dobré shody.

Klíčová slova

• conformations
• their
• sequence
• preferences