Mykotické infekce urogenitálního traktu jsou v běžné praxi s vyjímkou balanoposthitis mycotoca málo časté, avšak téměř vždy závažné. Neobřezaný muž je obvykle infikován při pohlavním styku s partnekrou trpící vulvovaginální mykózou pod klinickým obrazem mykotické balanitidy (balanoposthitis mycotica) event. uretritidy (urethritis non-specifica,u. mycotica).
Obřezaný muž onemocní vzácně a musí být k infekci disponován. U žen je obvykle postižena pochva a sekundárně močové cesty, avšak i žena onemocní mykotickým zánětem dolních cest močových jen v případě indispozice.
Zásadní význam mají mykózy u nemocných s imunodeficiencí, kdy nejčastějším zdrojem infekce je gastrointestinální trakt.