- SimTandem: Podobnostní vyhledávání v databázích hmotnostních spekter2012 | Matematicko-fyzikální fakulta
- Optimalizace nemetrického podobnostního vyhledávání v databázích MS/MS spekter s využitím klastrování2012 | Matematicko-fyzikální fakulta
- NM-strom: Flexibilní přibližné vyhledávání v metrických a nemetrických prostorech2008 | Matematicko-fyzikální fakulta